马铃薯种薯储存与粮食作物的储存相比有很大不同。禾谷类作物收获后的种子只要达到安全水分就比较容易储藏，马铃薯收获后的块茎含水量一般在80%左右，在储存期间易遭到病菌的侵染而腐烂。高温易伤热，低温易冻害，又由于马铃薯块茎既是营养器官又是繁殖器官，所以要采用科学的管理方法，才能将损失降到最低。
一、入库前的准备
1、库房准备。2、库房要求通风干燥。3、温度可控。库内用石灰水消毒地面和墙壁。4、并用甲醛和高锰酸钾熏蒸消毒(每120平方米用500克高锰酸钾、700毫升甲醛溶液）。5、种薯准备：将烂薯、病薯、冻薯、伤薯挑出，将好薯装入透气性好的袋内存放。保存好的种薯播种前1-2天切块或随切随种，不能早切，以防烂种。
二、堆放
休眠期短的品种不耐储藏，堆高在0.5-1米，储藏量不要超过全库容积的2/3，最好为1/2，便于管理。垛之间要留有空隙。
三、温湿度控制
种薯收获后，要增加种薯表皮木栓化的程度以提高储藏质量，温度保持在15℃-20℃，需要15天左右。进入降温阶段后，前期每天降1℃左右，当降至7℃左右时每天降0.5℃左右，最后稳定到2℃-3℃左右，开始进入安全储藏期。出库前温度逐渐上升到10℃-15℃，此时可以安全出库。储藏库的湿度始终保持在80%最好。
四、光照
种薯储藏对光照要求不严格，一般来说，种薯块茎表皮变绿有抑制病菌侵染的作用，也能抑制幼芽的徒长而形成短壮芽，有利于产量的提高。
五、通风
在种薯储藏期间，必须保证有流通的清洁空气，通风不良会防碍块茎的正常呼吸，影响种植后田间的出苗率。特别是刚入库时前半个月通风最关键，通风又可调节库内的温、湿度，保证种薯储存的安全。
总之，马铃薯种薯储存期间实行科学的管理方法，严格控制库内的温度、湿度和通风条件，确保种薯品质，降低储存期间的自然损耗，为马铃薯生产提供合格的种薯。
农户储藏少量种薯。